Генетическое разнообразие вируса гепатита С в Республике Беларусь

Приведены данные о распределении генотипов/подгенотипов вируса гепатита С (ВГС) у пациентов, проживающих в различных регионах Республики Беларусь, выявленные с использованием современных биоинформационных методов исследования. Показана взаимосвязь частоты распространения отдельных генотипов/ подгенотипов вируса у пациентов с различными путями инфицирования. Установлены генотипы/подгенотипы ВГС, доминирующие в стране в настоящее время.

Вирус гепатита С (ВГС) является значимой проблемой здравоохранения и одной из важнейших причин развития хронических заболеваний печени во всем мире. По данным Всемирной организации здравоохранения, число инфицированных ВГС в мире колеблется в пределах 130—150 млн человек. Частота формирования хронического процесса (ХГС) варьирует в пределах от 70 до 80%, приводя к развитию цирроза и гепатоцеллюлярной карциномы в 20% случаев [1]. Ежегодно в мире регистрируется 3—4 млн новых случаев инфицирования ВГС с уровнем смертности от цирроза печени, печеночной недостаточности или гепатоклеточной карциномы от 350 000 до 500 000 случаев [2, 3].

ВГС характеризуется высокой частотой спонтанных мутаций, что приводит к формированию высокой степени гетерогенности среди его генотипов/подгенотипов. В настоящее время классифицировано 7 филогенетически удаленных кластеров (генотипов), обозначаемых цифрами от 1 до 6, и 67 подгенотипов ВГС, обозначаемых буквами а, Ь, с, d и т. д. [4]. В разных странах генотипы имеют различное географическое распределение, пути распространения, этническую принадлежность. Данные вариабельности генома вируса широко используются для идентификации источника заражения.

В последние годы появилось новое направление, обозначенное как молекулярная эпидемиология, где учитываются вышеописанные факторы. Необходимо отметить, что высокий уровень генетической гетерогенности вируса является одной из причин невозможности создания средств специфической иммунопрофилактики заболевания [5].
Изучение молекулярной эпидемиологии такого проблемного возбудителя, как ВГС, играет важную роль в клиническом менеджменте хронической инфекции ВГС.

Так, пациенты, инфицированные генотипами 1 и 4 вируса, имеют более тяжелое течение инфекции и хуже отвечают на лечение препаратами интерферона, чем при инфекции, вызванной генотипами 2, 3, 5 или 6.

Эффективность терапии пациентов с данными генотипами ВГС достигает 80%, в то же время при лечении пациентов с 1-м или 4-м генотипами — не более 45%. Появившиеся в последние годы более эффективные препараты прямого действия имеют ограниченную доступность ввиду высокой стоимости [6].

Ежегодно в Беларуси регистрируется более 3000 новых случаев инфицирования, при этом около 90% случаев ВГС — среди трудоспособного населения страны с максимальным уровнем заболеваемости в возрасте 30—39 лет. Хотя за последние 13 лет заболеваемость острой формой снизилась почти в 2 раза — со 180 случаев в 2002 г. до 102 в 2015 г. (показатель заболеваемости составил 1,8/0000 и 1,08/0000 соответственно), устойчивая тенденция к росту хронической формы инфекции продолжает сохраняться. Так, в 2002 г. выявлено 1598 случаев (15,16/0000 случаев), в 2015 г. — 2918 случаев (30,89/0000) ХГС. Темп прироста в 2002—2014 гг. составил 82,6% [7].

Следовательно, постоянный мониторинг за распространением генотипов ВГС важен как для понимания эволюции и эпидемиологии этой инфекции в республике, так и для выбора обоснованной стратегии терапии и усовершенствования превентивных мер.

В соответствии с вышеизложенным целью работы явилось установление генотипов и определение родственных связей между генотипами вируса гепатита С, выявленными у ВГС- инфицированных пациентов в Республике Беларусь в 2004—2015 гг.

Выводы

1.    Разработанный метод секвенирования inhouse по участкам соrе/Е1 и NS5B генома ВГС со специфическими парами праймеров позволил выявить генотипы/подгенотипы ВГС и рекомбинантные формы вируса и определить частоту их встречаемости в разных регионах страны и республике в целом.

2.    Результаты генотипирования и филогенетического анализа 887 последовательностей РНК ВГС, собранных в 2004—2015гг., показали, что подгенотип а выявлялся в 63 (7,1%) случаях, 1b — в 530 (59,8%) случаях, 3а — в 246 (27,7%), генотип 2 — в 42 (4,7%), представленный 2а — в 17 (1,9%) случаях, 2с— в 7 (0,8%), 2k— в 5 (0,6%) случаях и 13 образцов являлись рекомбинантами типа CRF01_2k1b; в 5 (0,6%) случаях выявлен 4-й генотип, представленный 4а в 1 (0,1%) случае подгенотипом 4а и 4 (0,5%) — подгенотипом 4d ВГС.

3.    Показано, что в группе ПИН подгенотипы 1b и 3а ВГС встречались практически с равной частотой (40,5% и 37,2% соответственно), именно в этой группе выявлялось наибольшее количество пациентов с подгенотипом 1а ВГС — 17,4%.

4.    Для оценки частоты встречаемости и определения направлений заноса генотипов/ подгенотипов ВГС в разных группах населения, а также для проведения адресных превентивных мероприятий и индивидуализации схем терапии необходимо более широкое использование в практическом здравоохранении метода молекулярно-генетического мониторинга.

Контактная информация:
Гасич Елена Леонидовна — к. б. н., доцент, вед. науч. сотр. лаборатории диагностики ВИЧ и сопутствующих инфекций. Республиканский научно-практический центр эпидемиологии и микробиологии.
220114, г. Минск, ул. Филимонова, 23; сл. тел. (8-017) 268-04-42. Участие авторов:
Концепция и дизайн исследования: Е. Л. Г., В. Ф. Е. Сбор и обработка материала: Е. Л. Г., В. Ф. Е. Написание текста: Е. Л. Г. Редактирование: Е. Л. Г., В. Ф. Е. Конфликт интересов отсутствует.

Ключевые слова: , , , ,
Автор(ы): Гасич Е. Л., Еремин В. Ф.
Медучреждение: РНПЦ эпидемиологии и микробиологии Минздрава Республики Беларусь